El Latin American High Performance Computing Conference (CARLA) es un evento internacional que promueve el crecimiento y fortalecimiento de la comunidad de Computación de Alto Rendimiento (HPC) en América Latina. En su versión 2024, un grupo encabezado por Ana Moya Beltrán y conformado por estudiantes de pregrado de Ingeniería Civil en Ciencia de Datos y un estudiante del Doctorado en Informática Aplicada a Salud y Medio Ambiente (DIASMA), representó a la institución.

“Lo que nos motivó a participar fue dar a conocer nuestra carrera y el amplio campo en la cual esta se puede desarrollar tomando los datos como una ciencia, sea apoyando en diferentes tareas diarias como asistentes con IA hasta investigaciones científicas en diferentes áreas como por ejemplo la bioinformática”, comenta Hugo Osses, autor principal de uno de los proyectos.

El grupo presentó los siguientes trabajos:

– Hugo Osses: Integrating Natural Language Processing techniques to enhance genomic sequence analysis and characterization , sobre el uso del procesamiento de lenguaje natural (NLP) para analizar secuencias genómicas.

– Fernanda Bravo: Comparison machine learning-based models for predicting Streptococcus pyogenes virulence factors , un modelo comparativo de predicción de factores de virulencia.

– Belén Díaz: Leveraging Genomic and Phenotypic Data to Model AMR in Mycobacterium tuberculosis , centrado en la resistencia antimicrobiana en tuberculosis.

– Camilo Cerda: Antimicrobial Resistance in the Lung Microbial Community Using Unsupervised Machine Learning , que analiza la resistencia antimicrobiana en comunidades microbianas pulmonares.

– Esteban Gómez: Biomarker discovery in Lung Adenocarcinoma using a machine learning-based approach through metabolomic data , enfocado en el descubrimiento de biomarcadores.

– Diego Santibañez: Assessment of DNA Sequence Encoding techniques for Machine Learning Algorithms using a universal bacterial marker , un análisis de técnicas de codificación de ADN.

Respecto a este último trabajo, que fue presentado de forma oral, Hugo Osses comenta que “éste se centra en la aplicación del procesamiento de lenguaje natural (NLP) para el análisis y caracterización de secuencias genómicas, destacando cómo el modelo asigna ‘importancia’ o ‘atención’ a distintas subsecciones de la secuencia. Esto permite identificar puntos clave o significativos que pueden contribuir a investigaciones en el campo de la bioinformática”.

El equipo de trabajo tras esta investigación en específico está conformado por Hugo Osses Prado como autor principal, junto a Diego Santibañez, Fernanda Bravo, Camilo Cerda, Esteban Gómez y Belén Díaz como coautores, todos pertenecientes a la carrera de Ingeniería Civil en Ciencias de Datos. También bajo la guía y apoyo de Ana Moya Beltrán, Raúl Caulier Cisterna y Jorge Vergara Quezada, académicos del Depto. de Informática y Computación.

Aprendizajes y colaboraciones

Uno de los mayores desafíos a los que se enfrentaron las/os alumnas/os fue presentar en inglés, lo que demandó preparación y esfuerzo adicionales. “La experiencia de presentar en inglés fue desafiante. Además de realizar una presentación en un idioma en el cual no tenemos un buen dominio, tuvimos que pensar constantemente en inglés para familiarizarnos con el idioma y poder responder correctamente las preguntas”, comenta Diego Santibáñez. .

“Asimismo, fue necesario interactuar con otras/os asistentes del congreso, ya que muchos provenían de países donde el español no es el idioma nativo. Otro desafío importante fue la constante preocupación por mantener una pronunciación adecuada para que se pudiera entender claramente nuestro mensaje, así como el uso correcto del vocabulario técnico”, señala Santibáñez.

La participación en CARLA también permitió al grupo explorar nuevas aplicaciones de inteligencia artificial y bioinformática. “Durante los días del congreso vivimos variadas experiencias, participando en diferentes actividades tecnológicas como talleres de astro informática y programación de GPU en AMD, y CUDA, entre otras”, comenta Camilo Cerda .

Además, agrega que “estas herramientas son importantes en nuestra carrera y nos impulsa a tener oportunidades de desarrollo de nuevos proyectos de investigación y obtener experiencia para el ámbito profesional, relacionándonos con personas de primer nivel en distintos campos de la ciencia. Generando un complemento con nuestra carrera la cual es interdisciplinaria”.

Las oportunidades de colaboración internacional fueron clave. “Durante este congreso pudimos conocer a una gran variedad de personas de distintos países, como Alemania, Brasil, Colombia y compartir pensamientos e ideas sobre las nuevas tecnologías y culturas, hablar sobre el desarrollo de investigación en los distintos países de Europa y conocer cómo la ciencia de datos está impactando en el extranjero”, agrega Cerda.

Asimismo, explica que “dada el área de la bioinformática en la que nos estamos involucrando, y bajo la guía y apoyo de nuestra profesora Ana Moya, y también la orientación de nuestra carrera que nos impulsa a involucrarnos en distintos campos, prevemos que en el ámbito internacional tendremos variadas oportunidades, ya que durante CARLA se nos invitó a realizar un intercambio a una universidad en Alemania, y también a distintos tipos de doctorados dentro y fuera de Chile, ya que no es común ver a estudiantes de pregrado presentando trabajos en esas instancias”.

Revisa a continuación algunas fotografías del CARLA 2024: